Προβλήματα υπάρχουν και με την εφαρμογή του φόρου υπεραξίας σε περιπτώσεις πωλήσεων νομιμοποιημένων αυθαιρέτων και ημιτελών κτισμάτων, με αποτέλεσμα το υπουργείο να προχωρήσει στη συμπλήρωση των ρυθμίσεων που καθορίζουν τον τρόπο υπολογισμού των τιμών κτήσης των ακινήτων που κατά τη μεταβίβασή τους υπόκεινται σε φόρο υπεραξίας. Με απόφαση του αρμοδίου υφυπουργού Γ. Μαυραγάνη, καθορίζεται ο τρόπος υπολογισμού των τιμών κτήσης των ακινήτων σε δέκα ειδικές περιπτώσεις μεταβιβάσεων, στις οποίες έχει μεσολαβήσει ουσιαστική αλλαγή στη μορφή του ακινήτου μεταξύ της χρονικής στιγμής της αγοράς και της χρονικής της πώλησής του. Οι χαρακτηριστικότερες από αυτές είναι:
● Πολεοδομική τακτοποίηση εξ ολοκλήρου αυθαίρετης κατασκευής.
Σε περίπτωση απόκτησης ακάλυπτου οικοπέδου/αγροτεμαχίου και εν συνεχεία ανέγερσης επ’ αυτού κτίσματος, χωρίς οικοδομική άδεια ανέγερσης, και στη συνέχεια τακτοποίησης αυτού ως εξ ολοκλήρου αυθαιρέτου, ως τιμή κτήσης λαμβάνεται η τιμή κτήσης του ακάλυπτου οικοπέδου/αγροτεμαχίου (ανεξαρτήτως χρόνου απόκτησης αυτού) προσαυξημένη με συντελεστή 20%.
● Πολεοδομική τακτοποίηση μερικώς αυθαίρετης κατασκευής.
α) Σε περίπτωση απόκτησης με επαχθή αιτία κτίσματος και στη συνέχεια πολεοδομικής τακτοποίησης μερικώς αυθαίρετης κατασκευής (βοηθητικής ή κύριας χρήσης), προγενέστερης της απόκτησης του ακινήτου, ως τιμή κτήσης του συνολικά μεταβιβαζόμενου ακινήτου (νόμιμου και τακτοποιηθέντος) θεωρείται η τιμή κτήσης του νόμιμου κτίσματος.
β) Σε περίπτωση μεταγενέστερης της απόκτησης, η τιμή προσδιορίζεται με πρόσθεση στην αξία της αποκτηθείσης νόμιμης επιφάνειας της αξίας της τακτοποιημένης, η οποία προσδιορίζεται με αναγωγή στην αξία της νόμιμης επιφάνειας του κτίσματος, κατά τον λόγο της επιφάνειας της τακτοποιημένης προς την επιφάνεια της νόμιμης.
● Αποπεράτωση ημιτελούς κτίσματος.
Σε περίπτωση απόκτησης ημιτελούς κτίσματος και στη συνέχεια, είτε βάσει της ίδιας άδειας ανέγερσης είτε κατόπιν έκδοσης νέας άδειας ανέγερσης ή ανανέωσης της υπάρχουσας πολεοδομικής άδειας, πώλησης αυτού ως ημιτελούς -σε οποιοδήποτε στάδιο κατασκευής προ της αποπεράτωσής του-, η τιμή κτήσης υπολογίζεται με βάση την αξία που αυτό είχε αποκτηθεί. Σε περίπτωση πώλησης ως αποπερατωμένου, η τιμή κτήσης υπολογίζεται ως εξής: τιμή κτήσης ίσον τιμή μεταβίβασης επί τον Δείκτη Τιμών Κατοικιών (ΔΤΚατ) του έτους κτήσης διά του ΔΤΚατ του προηγούμενου της μεταβίβασης έτους.
● Μεταβίβαση ακίνητου που προήλθε μερικώς από ανέγερση.
Σε περίπτωση πώλησης ακινήτου-κτίσματος (συμπεριλαμβανομένων των αυτοτελών ιδιοκτησιών), το οποίο αποκτήθηκε κατά ιδανικό μερίδιο ως οικόπεδο και ανεγέρθηκε από τον πωλητή με αυτεπιστασία είτε με το σύστημα της αντιπαροχής, και απόκτησης από το ίδιο πρόσωπο, πριν από την πώληση, έτερου ποσοστού από άλλη αιτία (επαχθή ή χαριστική), η συνολική τιμή κτήσης του μεταβιβαζόμενου κτίσματος υπολογίζεται με την αναγωγή της αξίας του ποσοστού που αποκτήθηκε από άλλη αιτία στη συνολική αξία του μεταβιβαζόμενου ακινήτου.
● Νόμιμη προσθήκη κτίσματος.
Σε περίπτωση απόκτησης οριζόντιας ή κάθετης ιδιοκτησίας με επαχθή ή χαριστική αιτία ή λόγω κληρονομικής διαδοχής και εν συνεχεία κατασκευής νόμιμης προσθήκης, ως χρόνος κτήσης του μεταβιβαζόμενου ακινήτου (αρχικής και μεταγενέστερης κατασκευής) λαμβάνεται ο χρόνος έκδοσης της τελευταίας οικοδομικής άδειας.